В свой последний поход «Щ-403» вышла вечером 2 октября. Подлодка должна была действовать в районе мыс Сейбунес – мыс Омганг (между Тана и Конгс-фьордами, позиция № 5), но пропала без вести, ни разу не выйдя на связь. Вероятно, субмарина погибла на одной из мин линий «Koffer Gepackt» или «Konrad Begrusst» заграждения «NW-30», выставленных минным заградителем «Roland» 28 июня и 3 августа 1943 года. Вместе с подлодкой погибло 45 моряков.
16 боевых походов.
12.07.1941 – 30.07.1941
24.08.1941 – 28.08.1941
16.09.1941 – 19.09.1941
25.11.1941 – 01.12.1941
16.12.1941 – 04.01.1942
12.02.1942 – 19.02.1942
02.06.1942 – 11.06.1942
28.06.1942 – 08.07.1942
29.07.1942 – 12.08.1942
11.09.1942 – 23.09.1942
22.10.1942 – 07.11.1942
02.12.1942 – 19.12.1942
03.05.1943 – 12.05.1943
25.05.1943 – 10.06.1943
12.07.1943 – 23.07.1943
03.10.1943 – +
11 торпедных атак. Подтвержденных побед нет.