Королевский флот был хорошо осведомлён об общем расположении "Seeadler" и устроил ловушку, состоящую из торгового вооружённого крейсера "Otranto" и броненосных крейсеров "Lankaster" и "Orbita" у мыса Горн. Однако сильный шторм отнёс "Seeadler" значительно дальше на юг, прежде чем он вошёл в Тихий океан 18 апреля и пошёл на север вдоль чилийского побережья. К началу июня "Seeadler" находился к востоку от острова Рождества и узнал, что Соединённые Штаты вступили в войну. "Seeadler" обратил своё внимание на американские корабли, затопив 529-тонный корабль "A.B. Johnson" из Сан-Франциско 14 июня (это стало первым американским трофеем Германии в войне), 673-тонный "RC Slade" на следующий день и шхуну "Manila" 8 июля. К этому времени "Seeadler" был изношен так, что его корпус должен был быть очищен. Он подошёл к маленькому остров Мопела, также известному как Маупихаа, - коралловому атоллу в 6 миль в диаметре в 280 милях от Таити.
Но "Seeadler" был слишком велик, чтобы войти в защищённую лагуну Мопелы, и, следовательно, встал на якорь за пределами рифа. 24 августа случилась беда. Согласно рассказу фон Люкнера, корабль был поражён цунами, которая разрушила "Seeadler" об риф. Тем не менее, некоторые американские пленные утверждали, что корабль дрейфовал на мели, в то время как пленные и большинство членов команды были на пикнике на острове.
Команда и их 46 пленных теперь оказались на Мопеле, но им удалось спасти припасы, огнестрельное оружие и две спасательные шлюпки.
Фон Люкнер решил выйти с пятью своими людьми на одной из 10-метровых шлюпок, названной "Kronprinzessin Cecilie". Оставаясь даже в этот момент оптимистом, он собирался идти к Фиджи через острова Кука, захватить парусник, вернуться к Мопеле за своей командой и пленными и возобновить диверсионные рейды.
Через три дня после выхода из Мопелы они достигли острова Атиу в группе островов Кука, где они сделали вид, что они голландско-американские моряки, пересекающие Тихий океан на спор. Новозеландский резидент, администратор острова, дал им достаточно припасов, чтобы достичь другого острова в группе, Аитутаки, где они выдавали себя за норвежцев. Новозеландский резидент в Аитутаки отнёсся к ним с подозрением, но не было никакой возможности для задержания группы, и фон Люкнер со своей группой быстро взял курс на остров Раротонга. Подойдя к Раротонге в темноте, Люкнер увидел тёмный корабль, который он посчитал вспомогательным крейсером, тогда как на самом деле это было выброшенное на берег судно. Фон Люкнер вследствие этого взял курс на фиджийский остров Вакайя, прибыв туда после прохождения 3700 км на открытой лодке. Большинство людей на Вакайя приняли их историю потерпевших кораблекрушение норвежцев, но один скептик вызвал группу полицейских из старой фиджийской столицы Левука. 21 сентября полиция сымитировала выстрел из несуществующей пушки на межостровном пароме "Амра", угрожая затопить судно Люкнера. Не желая вызвать кровопролитие и не поняв, что полицейские не вооружены, Люкнер и его группа сдались и были заключены в лагере для военнопленных на острове Маупихаа недалеко от Окленда, Новая Зеландия.
Тем временем на Мопеле небольшое французское торговое судно "Lutece" бросило якорь за пределами рифа. Лейтенант Клинг с "Seeadler", услышав о захвате своего капитана по радио, направился к "Lutece" и захватил его под дулом пистолета. Французская команда была высажена с другими заключёнными, и все немцы вступили на корабль, который теперь был переименован в "Fortuna", и взяли курс на Южную Америку. Командир "A.B.Johnson" капитан Смит взял оставшуюся открытую лодку в Мопеле вместе с тремя другими американскими моряками и вышел в путь в 1600 км на Паго-Паго, прибыв туда 4 октября, где они смогли наконец сообщить властям о деятельности Seeadler 'а и провести мероприятия по спасению других 44 моряков, которые всё ещё находились на Мопеле.
"Fortuna" тем временем потерпела неудачу, когда натолкнулась на не отмеченные на карте скалы у острова Пасхи. Команда вскарабкалась на берег, где они были интернированы чилийцами до конца войны.
Фон Люкнер по-прежнему отказывался признать, что война закончилась для него. Командир лагеря для военнопленных в Мотуихе имел в своём распоряжении быструю моторную лодку "Pearl", и 13 декабря 1917 года фон Люкнер сымитировал начало рождественских игр вместе со своими людьми и использовал своё положение "играющего" для планирования своего побега. Фон Люкнер и ряд других заключённых захватили "Pearl" и дошли на ней до полуострова Коромандел. Используя пулемёт, он захватил 90-тонную шаланду "Моа" и с помощью вручную сделанного секстанта и карты, скопированной из школьного атласа, они отошли к острову Кермадек, который был новозеландским островом-базой с более крупными кораблями, стоявшими там на якоре. Преследующее его вспомогательное судно "Iris", угадало его вероятное местонахождение и догнало его 21 декабря. Через год после начала его миссии война, наконец, закончилась для Феликса фон Люкнера. Он провёл остаток войны в различных лагерях для военнопленных в Новой Зеландии, прежде чем был репатриирован в Германию в 1919 году.
12 мая 1921 года Люкнер стал масоном ложи Große Landesloge von Deutschland в Гамбурге. Он написал книгу о своих приключениях, которая стала бестселлером в Германии, и книга Лоуэлла Томаса о нём распространила славу Люкнера во всём мире.
В 1926 году он собрал средства, чтобы купить парусник, который он назвал "Vaterland", и отправился на нём с миссией доброй воли по всему миру, оставив Бремен 19 сентября и прибыв в Нью-Йорк 22 октября 1926 года. Поскольку он был талантливым оратором, им широко восхищались за его речи о его морской практике и за то, что он вёл свою войну с минимальными потерями жизни противника. Это открыло ему многие двери в Соединённых Штатах, где он выступал в сотнях мест по всей стране, сначала в немецком, а затем всё более на английском языке. Он заручился поддержкой многих знаменитостей, дипломатов, политиков и даже Американского легиона. Генри Форд подарил ему автомобиль, и город Сан-Франциско сделал его почётным гражданином. Президент Кулидж хотел лично встретиться с ним, но Люкнер отказался по просьбе своего правительства. Чувствуя, что его "миссия доброй воли", как он назвал её в своей книге "Seeteufel erobert Amerika" ("Морской дьявол покоряет Америку"), не сможет иметь больший успех в других местах и не может финансово поддерживаться доходом от его выступлений, пусть и весьма популярных и успешных, он вернулся в Германию, куда он прибыл 19 апреля 1928 года.
Он был частым гостем в доме Рейнхарда Гейдриха в Галле, где он вдохновил молодого Гейдриха рассказами о своих приключениях на "Seeadler" вступить в межвоенный Reichsmarine. В 1937 и 1938 году он и его жена совершили кругосветное путешествие на своей яхте "Seeteufel", будучи восторженно встреченными в Новой Зеландии и Австралии, хотя некоторые видели в нём апологета нацистского режима.
Во время Второй мировой войны Гитлер попытался использовать его в пропагандистских целях, хотя, как масон, он не был ни в одной из поощрявшихся нацистами групп людей. Он был замешан в скандале и поставлен перед судом Sonderehrengericht (специальный суд чести) в 1939 году за кровосмешение и половые связи с несовершеннолетними, но не был осужден. Говорят, что его уход из общественной жизни являлся условием для прекращения судебного разбирательства. Фон Люкнер отказался отречься от своего членства в масонах и от различных почётных гражданств, предоставленных ему в США за что его банковский счёт был заморожен. В 1943 году он спас жизнь еврейской женщины, Роуз Янсон, которой он предоставил паспорт, найденный на разбомблённом участке, и которой впоследствии удалось бежать в США через нейтральные страны. В конце войны мэр Галле, города, в котором он жил, попросил его провести переговоры о сдаче города с приближающимися американскими войсками, что он и сделал, хотя не вернулся в город, услышав, что нацисты приговорили его к смертной казни.
Фон Люкнер был чрезвычайно силён физически и был известен способностью сгибать монеты между большим, указательным и средним пальцами правой руки и рвать телефонные справочники (самый толстый он разорвал в Нью-Йорке) голыми руками. По случаю его визита в Австралию в 1938 году газета "Sydney Labour Daily" опубликовала карикатуру, показывающую кайзера Вильгельма, разрывающего пакт о бельгийском нейтралитете, Адольфа Гитлера, разрывающего ещё одно соглашение, и фон Люкнера, разрывающего каталог, с подписью "У них у всех привычка".
После Второй мировой войны Люкнер переехал в Швецию, где он жил в Мальме со своей второй женой-шведкой Ингеборг Энгестрем до самой своей смерти в Мальме в возрасте 84 лет в 1966 году. Он похоронен на кладбище Ольсдорф, Гамбург.
